葡萄糖-Tris-EDTA溶液(GTE)-太湖类芽孢杆菌-地衣形芽孢杆菌AS1.269
在基因组测序领域,MNase能够快速切割DNA,生成适合测序的片段,提高测序效率。
在现代分子生物学实验室中,Taq PCR Master Mix(2×)是一种极为重要的实验试剂,它为聚合酶链式反应(PCR)的高效进行提供了强大的支持。这种预混液以其便捷性和高效性,成为了众多科研人员和实验工作者的首选。 Taq PCR Master Mix(2×)是一种预先配制好的PCR反应体系,其浓度为常规反应所需浓度的两倍。它包含了Taq DNA聚合酶、dNTPs(脱氧核苷三磷酸)、反应缓冲液以及其他必要的成分,但不包含染料。这种设计使得实验人员在进行PCR反应时,只需将模板DNA、引物和水加入到预混液中,即可快速配制好反应体系,大大简化了实验操作步骤,节省了时间和精力。 Taq PCR Master Mix(2×)的高效性主要体现在以下几个方面。首先,它所含的Taq DNA聚合酶具有出色的耐热性和高效的DNA合成能力,能够在短时间内完成目标DNA片段的扩增。其次,预混液中的反应缓冲液经过优化,能够为Taq酶提供最佳的反应环境,确保反应的高效进行。此外,dNTPs的浓度也经过精确调整,能够满足PCR反应的需求,同时避免因过量而导致的副反应。
90% 甲酰胺(Formamide):用于变性核酸,使其保持单链状态。
在分子生物学实验中,PCR技术是不可或缺的工具,而Hot-Start Taq DNA Polymerase则是这一技术中的一颗璀璨明珠。它以其独特的机制和卓越的性能,为PCR反应的精准性和特异性提供了强有力的保障。 传统的Taq DNA聚合酶在室温下就具有活性,这意味着在PCR反应开始之前,引物可能会与模板发生非特异性结合,导致背景产物的产生,从而影响实验结果的准确性。而Hot-Start Taq DNA Polymerase通过特殊的化学修饰或物理方法,解决了这一问题。它在室温下处于“关闭”状态,只有在高温下才会被激活,从而有效避免了非特异性扩增的发生。 Hot-Start Taq DNA聚合酶的激活机制通常基于两种方式。一种是通过化学修饰,如在酶的活性位点引入可逆的化学基团,这些基团在高温下被去除,从而恢复酶的活性。另一种是通过物理方法,如将酶与抗体结合,抗体在高温下变性失活,从而释放出具有活性的Taq酶。无论哪种方式,其核心目标都是确保Taq酶在PCR反应的变性阶段才开始发挥作用。
使用前建议在65℃水浴中加热5分钟,然后在冰浴中冷却3分钟,以避免COS位点的片段结合。
Cre重组酶(Cyclization Recombination Enzyme)是一种位点特异性重组酶,最早于1981年从P1噬菌体中发现。它能够识别并结合特定的DNA序列——LoxP位点,进而引发DNA重组。LoxP位点是一个34bp的DNA序列,包含两个13bp的反向重复序列和一个8bp的间隔区。 工作原理 Cre重组酶通过与LoxP位点的反向重复序列结合形成二聚体,进而形成四聚体复合物。随后,Cre重组酶切割LoxP位点之间的DNA片段,并通过DNA连接酶重新连接切口。重组结果取决于LoxP位点的方向和位置。例如: 若两个LoxP位点方向相同,Cre重组酶可切除它们之间的DNA片段。 若方向相反,则可导致DNA片段翻转。 若LoxP位点位于不同DNA链上,Cre重组酶可介导DNA链交换或染色体易位。 应用 Cre/LoxP系统广泛应用于基因编辑领域,包括基因敲除、基因插入、基因翻转和染色体重排等。它特别适合构建条件性基因敲除小鼠模型,通过组织特异性启动子控制Cre重组酶的表达,从而实现对特定组织或细胞中目标基因的时空特异性敲除。
上样与电泳:混合均匀后,将样品加入琼脂糖凝胶的加样孔中,进行电泳。
核酸内切酶VIII(Endonuclease VIII,Endo VIII)是一种具有N-糖基化酶和AP-裂解酶活性的DNA损伤修复酶,广泛应用于基因损伤修复研究。其截短体则是通过基因工程改造,删除部分氨基酸序列而获得的变体,通常用于特定的研究目的,如提高酶的稳定性或特异性。 功能与特性 N-糖基化酶活性:识别并切除双链DNA上受损的嘧啶碱基,产生脱嘌呤(AP)位点。 AP-裂解酶活性:在AP位点的3'和5'端切割磷酸二酯键,产生具有3'和5'磷酸的碱基缺口。 高纯度与稳定性:核酸内切酶VIII截短体通过重组表达获得,纯度高,无核酸外切酶、核酸内切酶和RNase残留。 热失活:75℃孵育10分钟可使酶失活。 应用场景 DNA损伤修复研究:用于模拟和修复DNA损伤,特别是在氧化损伤研究中。 单细胞凝胶电泳(彗星试验):评估细胞内和体外的氧化DNA损伤。 NGS建库:在二代测序中,特异性切除含AP位点的模板链,实现双端测序。 酶法合成DNA:释放DNA链,用于合成特定的DNA结构。
将 4S Green 10000× 储液稀释至 3× 染色液,将凝胶浸泡其中,室温振荡染色 30 分
在分子生物学实验中,DNA的完整性和准确性是实验成功的关键。Uracil-DNA Glycosylase(UDG)是一种能够特异性识别并修复DNA中尿嘧啶(U)的酶,广泛应用于PCR反应和其他DNA合成实验中。然而,传统的UDG在反应结束后需要额外的处理步骤来失活酶活性,以防止对后续实验的干扰。热敏感型UDG(Heat-labile UDG,1U/μl)的出现,为这一问题提供了高效的解决方案。 热敏感型UDG的独特特性 热敏感型UDG(Heat-labile UDG)是一种经过工程改造的UDG,来源于细菌。与传统的UDG不同,这种酶在高温条件下(通常在95℃)会迅速失活。这一特性使其在PCR反应中具有显著优势。在反应开始前,UDG可以有效去除引物或模板中的尿嘧啶,防止非特异性扩增。而在PCR反应的高温变性步骤中,UDG会自动失活,无需额外的处理步骤,从而简化了实验流程。 热敏感型UDG的应用 热启动PCR:在PCR反应中,热敏感型UDG可以用于防止引物二聚体的形成和非特异性扩增。通过在反应前加入UDG,可以降解引物中的尿嘧啶,从而避免引物在反应前的非特异性结合。
若两个LoxP位点方向相同,Cre重组酶可切除它们之间的DNA片段。
在分子生物学实验中,DNA合成是许多技术的核心,而dNTP/dUTP Mixture (2.5 mM each/5 mM)作为一种特殊的试剂,为DNA合成提供了更多可能性。这种混合液结合了四种脱氧核苷三磷酸(dATP、dCTP、dTTP、dGTP)和脱氧尿苷三磷酸(dUTP),为PCR反应和其他DNA合成实验提供了多功能的支持。 dNTP/dUTP Mixture的独特优势 dNTP/dUTP Mixture (2.5 mM each/5 mM)是一种精心设计的混合液,其中每种dNTP的浓度为2.5 mM,而dUTP的浓度为5 mM。这种独特的配方使其在多种实验中表现出色: PCR反应中的应用:在传统的PCR反应中,dNTPs是DNA合成的基本原料。然而,dUTP的加入为PCR反应提供了额外的功能。例如,某些PCR反应需要引入dUTP来标记DNA,或者在后续实验中利用尿嘧啶糖基化酶(UNG)去除dU,从而实现PCR产物的特异性降解。这种混合液能够满足这些特殊需求,同时保持反应的高效性和特异性。
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